Sistem kerja dan penggunaan mesin absensi sidik jari terbilang sangat pesat dan sensitif. Sensor pendeteksi sidik jari menggunakan sistem optikal, dimana pendektesian dilakukan dengan pembacaan garis sidik jari. Hal ini menghasilkan tingkat keamanan yang tinggi, karena tidak bisa dipalsukan bahkan dengan cetak lilin sidik jari sekalipun. Sistem kerja absensi sidik jari dengan komputer atau yang lebih dikenal absensi sidik jari online ini sangat bergantung dengan komputer. Absensi sidik jari ada yang terkoneksi komputer (online) dan tanpa terkoneksi ke komputer (offline).
Sistem kerja kedua mesin absensi ini pada dasarnya sama, sangat tergantung dengan komputer. Langkah pertama yang dilakukan adalah mendaftarkan sidik jari karyawan untuk selanjutnya karyawan dapat menggunakan jarinya sebagai absensi tentu saja dengan jari yang sudah tersimpan di alat. Jadi karyawan tidak perlu repot-repot membawa kartu atau kertas amano. Hasil data absensi pada akhirnya akan menghasilkan data laporan dari record masuk, pulang, terlambat, pulang cepat sampai total jam kerja sesuai kebutuhan perusahaan. Begitulah sistem kerja absensi pada umumnya.
